Im Jahre 2065: Die Erde ist verwüstet, die Menschheit fast ausgerottet und viele Tier- und Pflanzenarten ausgestorben. Aber es kommt noch schlimmer: Ein paar äußerst übellaunige Außerirdische befinden sich im Anflug auf die Erde und drohen unserem Heimatplanten entgültig den Rest zu geben. Während General Hein zu deren Abwehr an einer Megakanone bastelt, deren Abschuss freilich nicht ohne Nebenwirkungen für die eh schon arg geschundene Umwelt wäre, sinnt Physikerin Aki Ross zusammen mit ihrem väterlichen Freund Dr. Sid und unterstützt von einem kleinen Trupp aufrechter Elite-Kämpfer, den "Deep Eyes", nach sensibleren Abwehrmethoden...