Bei Deadly Dozen: Pacific Theater taucht man in das Jahr 1942 ein. Japaner und Amerikaner stehen sich im Pazifik siegessicher gegenüber. Mit Deadly Dozen (im November 2001 erschienen) hat der Entwickler N-Fusion bereits Erfahrungen mit dem Zweiten Weltkrieg sammeln können. Während dort der Kriegsschauplatz Europa im Mittelpunkt stand, nimmt sich Deadly Dozen: Pacific Theater dem Kampf im Pazifik zwischen Japanern und Amerikanern an. Man ist Teil der Anfang 1942 gegründeten Spezialeinheit "1st Special Naval Force", die aus 12 guttrainierten Marinesoldaten besteht. Selbstredend wird man in zahlreiche Missionen gegen den Gegner Japan geschickt, um spezielle Angriffe durchzuführen oder auch Kriegsgefangene zu befreien.