Nackt erwacht ein junger Mann auf einer Insel. Niemand, nicht einmal der Fremde selbst, weiß, wer er ist und woher er kommt. Seltsam sind auch seine Farbenblindheit und ein mysteriöses Brandzeichen auf seiner Schulter. Die Erinnerung an sein Leben ist komplett ausgelöscht, doch dafür hat der Mann, der sich selbst den Namen 'John Doe' gibt, eine schier unglaubliche Eigenschaft: Das komplette Wissen der Welt scheint in seinem Kopf abgespeichert zu sein, er ist ein wandelndes Universal-Lexikon. Zudem kann er Dinge vorhersehen, allerdings nicht beeinflussen - und er besitzt einen siebten Sinn. Verwirrt, aber kompetent wie kein Zweiter, stellt er seine Fähigkeiten den Polizeibeamten Jamie Avery und Frank Hayes zur Verfügung. Zunächst sind die beiden skeptisch, doch dann kann ihnen der rätselhafte Fremde bei einem Entführungsfall die entscheidenden Hinweise geben. Zusammen gehen sie auf Verbrecherjagd - und auf die Suche nach John Does Vergangenheit.

Die 1. Staffel besteht aus folgenden Episoden:

01 - Zukunft ohne Vergangenheit (Pilot)
02 - Blutspur
03 - Therapie-Wahnsinn
04 - Die Leiche im Fass
05 - Wo ist Doe Nr - 2?
06 - Die Kunst des Verschwindens
07 - Der Club der Genies
08 - Die Heimkehr
09 - Mord über den Wolken
10 - Herzliches Beileid
11 - Das Spiel geht weiter
12 - Tod durch Musik
13 - Der Doppelgänger
14 - Auf der Suche nach Phoenix
15 - Die Hellseherin
16 - Besuch aus dem All?
17 - Pockenalarm in Seattle
18 - Der Fall Moretti
19 - Vom Blitz getroffen
20 - In den Fängen von Terroristen
21 - Wie Phoenix aus der Asche