Als der Heimatplanet der Thundercats 'Thundera' dem Untergang geweiht war, flüchteten sie mit der mächtigsten Waffe des Universums, dem Auge von Thundera, zur dritten Erde. Jedoch wurden sie von den Mutanten des Planeten Plundarr verfolgt, die diese Waffe für sich haben wollten.
Auf der dritten Erde leben nur Mutanten und Fabelwesen. Der Frieden wird durch ständige Kämpfe gestört, obwohl die Thundercats eigentlich ein friedlebendes Katzenvolk sind. Die bösen Mächte der dritten Erde lassen nichts unversucht, um an das Auge von Thundera zu kommen. Dadurch werden die Thundercats gezwungen, sich mit Hilfe der Mächte der dritten Erde zu verbünden, um Mumion und seinen Truppen sowie den anderen Mutanten & Raumpiraten Einhalt zu gebieten. Leo, der Anführer der Thundercats, aktiviert das Auge von Thundera, dass vor Urzeiten in ein Zauberschwert eingelassen wurde und dessen Energiestrom nur er bändigen kann.

Die Serie bestand aus insgesamt 130 Folgen, was ihren Erfolg bewies. Neben der Serie gab es auch jede Menge Spielzeug rund um die Katzen. Neben den Figuren und den Fahrzeugen fanden auch Poster und andere Dinge regen Absatz.